Научная визуализация

Scientific Visualization

Электронный журнал открытого доступа

 Национальный Исследовательский Ядерный Университет "МИФИ"

      ISSN 2079-3537      

 
 
 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             
Научная визуализация
Год выпуска: 2017
Квартал: 4
Том: 9
Номер: 4
Страницы: 59 - 66
Название публикации: ТРЕХМЕРНАЯ ВИЗУАЛИЗАЦИЯ ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИХ ДЕРЕВЬЕВ
Авторы: М.А. Форгани (Россия), П.А.Васёв (Россия), В.Л. Авербух (Россия)
Статья рекомендована к печати программным комитетом 27-й Международной конференции по компьютерной графике и зрению ГрафиКон'2017.
Адреса авторов: М.А. Форгани
majid.forqani@gmail.com
Уральский федеральный университет, Екатеринбург, Россия

П.А.Васёв
vasev@imm.uran.ru
Институт математики и механики имени Н.Н. Красовского УрО РАН, Екатеринбург, Россия

В.Л. Авербух
averbukh@imm.uran.ru
Уральский федеральный университет, Екатеринбург, Россия
Институт математики и механики имени Н.Н. Красовского УрО РАН, Екатеринбург, Россия
Краткое описание: Филогенетические деревья используются для демонстрации эволюционной взаимосвязи между видами. Предыдущие исследования показали, что существует корреляция между мутациями и изменениями физико-химических свойств аминокислот. Рассмотрение физико-химических изменений белка дает дополнительные точки зрения на изучение процесса мутации. Система VirTree была разработана для визуализации ультраметрических филогенетических деревьев. Система создает трехмерное представление деревьев, а кроме того обеспечивает представление в среде виртуальной реальности. Система кластеризует объекты филогенетического дерева на основе физико-химических свойств аминокислоты, в то время как каждый лист имеет свою последовательность белка. Листья данного дерева также могут быть кластеризованы на основе структуры дерева и ветви, в которой они расположены. Добавление новой мерности дает возможность визуализировать каждый кластер индивидуально. Алгоритм кластеризации использует метрику на основе преобразования вейвлет-пакетов и метода классического многомерного шкалирования. В дополнение к двух- и трёхмерным визуализациям реализовано представление деревьев в среде виртуальной реальности. Средства виртуальной реальности предоставляются через посредство системы Viewlang. Она позволяет создавать интерактивные трёхмерные графические приложения, работающие в браузерах. Виртуальная реальность значительно увеличивает информативность визуализации и обеспечивает широкий спектр обзора. Это позволяет увидеть общую картину больших деревьев с деталями, что затруднительно в случае «традиционных» методов визуализации из-за ограниченного размера экрана монитора.
Язык: Английский
DOI: http://doi.org/10.26583/sv.9.4.06


Открыть публикацию   Скачать публикацию в ZIP архиве