Научная визуализация

Scientific Visualization

Электронный журнал открытого доступа

 Национальный Исследовательский Ядерный Университет "МИФИ"

      ISSN 2079-3537      

 
 
 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             
Научная визуализация
Год выпуска: 2012
Квартал: 3
Том: 4
Номер: 3
Страницы: 1 - 7
Название публикации: КОМПЬЮТЕРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ СУПРАМОЛЕКУЛЯРНОЙ СИСТЕМЫ, СОСТОЯЩЕЙ ИЗ МОЛЕКУЛ ФЛУОРЕСЦЕНТНЫХ КРАСИТЕЛЕЙ, ЛИПИДОВ И ВОДЫ
Авторы: С. Зайцев (Россия), М. Шапошников (Россия), Д. Соловьева (Россия), М. Бартов (Россия), П. Волынский (Россия)
Адреса авторов: С. Зайцев
s.y.zaitsev@mail.ru
Московская государственная Академия ветеринарной медицины и биотехнологии имени К.И. Скрябина, Москва, Россия
 
М. Шапошников
mihan2404@mail.ru
Московская государственная Академия ветеринарной медицины и биотехнологии имени К.И. Скрябина, Москва, Россия
 
Д. Соловьева
d.solovieva@mail.ru
Московская государственная Академия ветеринарной медицины и биотехнологии имени К.И. Скрябина, Москва, Россия
 
М. Бартов
_ariman_@list.ru
Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Москва, Россия
 
П. Волынский
Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Москва, Россия
Краткое описание: Проведено моделирование процесса взаимодействия новых производных родаминов - фотоактивируемых флуоресцентных красителей (ФФК) и липидного бислоя - аналога природных мембран на основе 1- пальмитоил-2-олеоил-sn-глицеро-3-фосфатидилхолина (ПОФХ) с помощью метода молекулярной динамики с использованием средств визуального анализа полученных результатов. Супрамолекулярная система содержала 2 молекулы ФФК, помещенные в воду по разные стороны бислоя (сверху и снизу от него), 128 молекул ПОФХ и 5258 молекул воды. Активное связывание ФФК с ПОФХ начиналось уже через 350 пс, причем обе молекулы ФФК стремились расположиться ближе к центру бислоя. В ходе изучения параметров взаимодействия ФФК с ПОФХ была рассчитана радиальная функция распределения молекул красителя относительно воды. Выявленные особенности поведения ФФК при движении сквозь липидную мембрану важны для разработки методик окрашивания такими красителями клеток и препаратов органов и тканей в медицине человека и животных.
Язык: Русский